Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms