Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms