Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms