Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD50Q92878 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD50Q92878 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms