Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms