Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms