Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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