Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMYD1Q8NB12 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms