Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms