Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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TMCO5AQ8N6Q1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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TMCO5AQ8N6Q1 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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TMCO5AQ8N6Q1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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TMCO5AQ8N6Q1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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TMCO5AQ8N6Q1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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