Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC82Q8N4S0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms