Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFRP1Q8N474 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms