Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RASSF3Q86WH2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RASSF3Q86WH2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RASSF3Q86WH2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RASSF3Q86WH2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RASSF3Q86WH2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RASSF3Q86WH2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RASSF3Q86WH2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RASSF3Q86WH2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RASSF3Q86WH2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RASSF3Q86WH2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RASSF3Q86WH2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RASSF3Q86WH2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RASSF3Q86WH2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RASSF3Q86WH2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RASSF3Q86WH2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RASSF3Q86WH2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RASSF3Q86WH2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RASSF3Q86WH2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RASSF3Q86WH2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RASSF3Q86WH2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RASSF3Q86WH2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RASSF3Q86WH2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RASSF3Q86WH2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RASSF3Q86WH2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RASSF3Q86WH2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RASSF3Q86WH2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RASSF3Q86WH2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms