Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms