Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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