Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms