Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms