Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN4Q5MJ08 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPANXN4Q5MJ08 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPANXN4Q5MJ08 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPANXN4Q5MJ08 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPANXN4Q5MJ08 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPANXN4Q5MJ08 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPANXN4Q5MJ08 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN4Q5MJ08 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN4Q5MJ08 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN4Q5MJ08 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN4Q5MJ08 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN4Q5MJ08 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN4Q5MJ08 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN4Q5MJ08 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN4Q5MJ08 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN4Q5MJ08 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN4Q5MJ08 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN4Q5MJ08 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN4Q5MJ08 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN4Q5MJ08 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms