Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITRM1Q5JRX3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms