Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms