Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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