Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms