Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms