Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms