Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRR4Q16378 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms