Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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