Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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