Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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