Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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NCF4Q15080 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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