Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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