Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGRF1Q13972 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms