Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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