Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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