Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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MTMR3Q13615 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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