Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms