Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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