Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 MS4A6A-201ENST00000412309 1284 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AL162253.1-201ENST00000443792 758 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AL035563.1-201ENST00000609087 1539 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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