Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLAMF1Q13291 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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