Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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