Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms