Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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