Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFEMP1Q12805 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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