Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms