Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms