Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD51Q06609 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms