Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms