Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms