Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms