Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APBA1Q02410 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms