Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF3P78545 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF3P78545 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms